Zgodnie z obowiązującymi przepisami dyrektor sądu kontroluje wydatki środków publicznych, których dysponentem jest Minister Sprawiedliwości, oraz gospodaruje mieniem Skarbu Państwa. Jest też zwierzchnikiem służbowym pracowników sądu, a nie ma takich uprawnień wobec sędziów, asesorów, referendarzy, kuratorów, asystentów czy aplikantów, którzy pozostają wobec niego niezależni.
Zgodnie z przyjętym przez Radę Ministrów projektem Minister Sprawiedliwości będzie uprawniony do powoływania i odwoływania dyrektorów sądów oraz ich zastępców. Obowiązywać mają przy tym zasady określone dla stosunków pracy na podstawie powołania, zawarte w Kodeksie pracy.
Ministerstwo Sprawiedliwości zaznacza, że zmiana relacji z dyrektorami sądów w żaden sposób nie będzie miała wpływu na kompetencje prezesów sądów w zakresie nadzoru nad działalnością orzeczniczą sądów.
Jak pisze Ministerstwo Sprawiedliwości, po zmianie przepisów i jednoznacznym rozdzieleniu funkcji administracyjnych od czynności orzeczniczych, prezesi sądów będą mieli więcej czasu na wykonywanie swoich obowiązków związanych z nadzorem nad działalnością sądów w zakresie orzekania. Ministerstwo Sprawiedliwości rezygnuje także trybu konkursowego na rzecz trybu powołania określonego w Kodeksie pracy, tak aby „uporządkować system i zwiększyć sprawność w zarządzaniu kadrami i finansami sądów” .