Rola Sztabu Generalnego zostanie poważnie ograniczona, powstaną dwa dowództwa - generalne i operacyjne, znikną natomiast dowódcy poszczególnych rodzajów wojsk - takie zmiany w systemie dowodzenia armią zaaprobował rząd. Zdaniem opozycji to prawdziwa rewolucja, która osłabi polskie siły zbrojne.
Według projektu Sztab Generalny ma stać się organem doradczym szefa MON-u a także instytucją zajmującą się planowaniem. Armią mają kierować dwaj dowódcy - generalny (dowodzący w czasie pokoju) i operacyjny (zarządzający wojskiem w czasie wojny i działań poza granicami kraju).