Mirzijojew pełnił obowiązku premiera od 2003 roku, a w ostatnich miesiącach także i prezydenta, zastępstwa którego zrzekł się przewodniczący uzbeckiego Senatu Nigmatilla Juldaszew. Ostatni prezydent kraju Islam Karimow zmarł na początku września tego roku. 59-letni Szawkat Mirzijojew przez ekspertów od początku typowany był na zwycięzcę wyborów. Centralna Komisja Wyborcza Uzbekistanu uzyskał 88,61 proc. wszystkich głosów. Poparło go 15,9 mln z 20 uprawnionych do głosowania mieszkańców kraju. Przed wyborami Mirzijojew zapewniał, że nie będzie wprowadzał zmian w stosunku do polityki uprawianej przez prezydenta Karimowa. Zapowiedział dążenie do zacieśnienia stosunków z krajami Wspólnoty Niepodległych Państw (WNP), zwłaszcza z Rosją.
Zastąpić Karimowa
Poprzedni prezydent Islam Karimow sprawował władzę nad Uzbekistanem nieprzerwanie od 1989 roku. Najpierw był szefem partii komunistycznej, a później został prezydentem. Po ogłoszeniu niepodległości od ZSRR w 1991 roku zatwierdzano go przez kolejne wybory. Jak zaznacza agencja Reutera, Karimow kierował systemem represyjnym wobec politycznej opozycji, jednak był zdecydowanym oponentem środkowoazjatyckiego fundamentalizmu islamskiego. Pogorszenie stanu zdrowia i śmierć prezydenta Karimowa miało być następstwem udaru mózgu.