Baza Edwards jest alternatywnym lądowiskiem dla promów kosmicznych. Lądowanie na Przylądku Canaveral na Florydzie, pierwotnie planowane na czwartek, a później przełożone na piątek, okazało się niemożliwe z powodu złej pogody.
Większość dwutygodniowej misji orbitalnej Atlantis spędził przycumowany do Międzynarodowej Stacji Kosmicznej (ISS), na którą dostarczył nowy zestaw baterii słonecznych. W składzie siedmioosobowej załogi wahadłowca, która powróciła na Ziemię, była amerykańska astronautka Sunita Williams, która pracowała na pokładzie ISS od grudnia ubiegłego roku. Jej miejsce na międzynarodowej stacji w towarzystwie Rosjan Fiodora Juriczkina i Olega Kotowa zajął przybyły wahadłowcem Clayton Anderson.
Rozpoczęty 9 czerwca nad ranem czasu polskiego orbitalny lot Atlantis miał potrwać 11 dni, ale przedłużono go w celu dokonania naprawy uszkodzonej podczas startu osłony termicznej wahadłowca. Dodatkową komplikacją obecnej misji była awaria rosyjskiego systemu komputerowego ISS, co na pewien czas wyłączyło z użytku rakietowe silniki korekcyjne stacji. Komputery wznowiły pracę po dwóch dniach, zwalniając wahadłowiec Atlantis z roli stabilizowania całego kompleksu orbitalnego.
Pierwszy w tym roku kosmiczny lot amerykańskiego wahadłowca opóźnił się o trzy miesiące. Pod koniec lutego, gdy Atlantis stał już przygotowany na platformie startowej, gradobicie uszkodziło powłokę izolacyjną zbiornika z paliwem. Konieczność naprawy osłony spowodowała przełożenie startu z marca na czerwiec.pap, ss