Wróg fundamentalizmu
Ostatecznie nowym przywódcą duchowo-politycznym został ajatollah Sajed Mohammad Ali Chamenei, który funkcję tę sprawuje po dziś dzień. Gdy Montazeri jawnie potępił instytucję zwierzchniej władzy duchownej nad Iranem i samą osobę Alego Chameneiego, władze nałożyły na niego areszt domowy w 1997 roku. Uwięziony ajatollah nie zaprzestał publikowania swych apeli o pluralizm i tolerancję oraz ograniczenie władzy najwyższego przywódcy duchowego. W styczniu 2003 roku wyszedł na wolność. Oficjalnym powodem zniesienia aresztu domowego wobec sędziwego duchownego był jego wiek i zły stan zdrowia.
"Władza absolutna obraża Allaha"W czerwcu 2003 roku Montazeri był jednym z sygnatariuszy jednostronnego protestu podpisanego przez 248 wpływowych dysydentów irańskich, którzy występowali w obronie prawa do krytykowania przywódców państwowych. W dokumencie napisano, że naród irański ma "prawo do pełnej kontroli działań swoich przywódców", a "władza absolutna jest czystą herezję w stosunku do Boga i jest całkowicie sprzeczna z ludzką godnością".
PAP, arb