Według "Gazety Wyborczej" Muszyński w życiorysie, który przedstawił sejmowej komisji sprawiedliwości pominął lata 90. Miał jedynie ogólnie stwierdzić, że po studiach na Wydziale Prawa i Administracji Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu „uczęszczał na prokuratorską aplikację pozaetatową”, a potem był szefem działu prawnego Ambasady RP w Berlinie. Muszyński jako pierwszą datę w swoim biogramie podaje 2002 rok. Wtedy zaczął prowadzić wykłady na Uniwersytecie im. kard. Wyszyńskiego (UKSW).
Ponadto "Gazeta Wyborcza" ustaliła, że w 1993 r. – po studiach prawniczych – Muszyński został przyjęty do UOP i skierowany na szkolenie w Ośrodku Kształcenia Wywiadu w Kiejkutach Starych. W życiorysie Muszyńskiego, który znajduje się w Wikipedii początek lat 90. to „stypendium na Uniwersytecie Wiedeńskim”.
Mariusz Muszyński to jeden z sędziów wybranych przez Sejm w grudniu 2015 r. głosami PiS i klubu Kukiz’15. Nie są oni jednak dopuszczani do orzekania przez prezesa TK Andrzeja Rzeplińskiego. Ich wybór Trybunał uznał za niekonstytucyjny.